Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG3

Scel, Sciellin, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScelQ9EQG3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScelQ9EQG3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScelQ9EQG3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ScelQ9EQG3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScelQ9EQG3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ScelQ9EQG3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ScelQ9EQG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScelQ9EQG3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScelQ9EQG3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ScelQ9EQG3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScelQ9EQG3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ScelQ9EQG3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ScelQ9EQG3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScelQ9EQG3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ScelQ9EQG3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms