Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr1Q9EPQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr1Q9EPQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr1Q9EPQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr1Q9EPQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms