Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp2Q9EPK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rp2Q9EPK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rp2Q9EPK2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rp2Q9EPK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rp2Q9EPK2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rp2Q9EPK2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms