Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgap1Q9EPJ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgap1Q9EPJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgap1Q9EPJ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms