Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ergic1Q9DC16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ergic1Q9DC16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ergic1Q9DC16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic1Q9DC16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ergic1Q9DC16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic1Q9DC16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms