Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riok3Q9DBU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riok3Q9DBU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Riok3Q9DBU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riok3Q9DBU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Riok3Q9DBU3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms