Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBI0

Tmprss6, Transmembrane protease serine 6, mousemouse

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss6Q9DBI0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmprss6Q9DBI0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmprss6Q9DBI0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmprss6Q9DBI0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmprss6Q9DBI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmprss6Q9DBI0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmprss6Q9DBI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmprss6Q9DBI0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmprss6Q9DBI0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms