Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smco2Q9DA21 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smco2Q9DA21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smco2Q9DA21 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smco2Q9DA21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smco2Q9DA21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smco2Q9DA21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smco2Q9DA21 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms