Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA17

Tsga13, Testis-specific gene 13 protein, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga13Q9DA17 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsga13Q9DA17 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsga13Q9DA17 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsga13Q9DA17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsga13Q9DA17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsga13Q9DA17 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsga13Q9DA17 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsga13Q9DA17 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.2 ms