Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S3

Rwdd2a, RWD domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2aQ9D9S3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd2aQ9D9S3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd2aQ9D9S3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rwdd2aQ9D9S3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd2aQ9D9S3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd2aQ9D9S3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd2aQ9D9S3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rwdd2aQ9D9S3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd2aQ9D9S3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rwdd2aQ9D9S3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms