Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmco5aQ9D9D5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmco5aQ9D9D5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmco5aQ9D9D5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmco5aQ9D9D5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.1 ms