Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl17Q9D8P4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mrpl17Q9D8P4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl17Q9D8P4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl17Q9D8P4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl17Q9D8P4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl17Q9D8P4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms