Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl4Q9D8E6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl4Q9D8E6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpl4Q9D8E6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl4Q9D8E6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl4Q9D8E6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpl4Q9D8E6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms