Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fip1l1Q9D824 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fip1l1Q9D824 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fip1l1Q9D824 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fip1l1Q9D824 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fip1l1Q9D824 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms