Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm5Q9D806 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm5Q9D806 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm5Q9D806 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm5Q9D806 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm5Q9D806 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm5Q9D806 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm5Q9D806 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 466.8 ms