Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp4cQ9D7F7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chmp4cQ9D7F7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp4cQ9D7F7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4cQ9D7F7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chmp4cQ9D7F7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms