Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ca13Q9D6N1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ca13Q9D6N1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca13Q9D6N1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ca13Q9D6N1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ca13Q9D6N1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms