Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
4930449I24RikQ9D5E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930449I24RikQ9D5E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4930449I24RikQ9D5E3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930449I24RikQ9D5E3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930449I24RikQ9D5E3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms