Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930513O06RikQ9D549 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930513O06RikQ9D549 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930513O06RikQ9D549 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930513O06RikQ9D549 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930513O06RikQ9D549 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms