Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc13Q9D548 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc13Q9D548 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc13Q9D548 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms