Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam227bQ9D518 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam227bQ9D518 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam227bQ9D518 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam227bQ9D518 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam227bQ9D518 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms