Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4931423N10RikQ9D4J9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4931423N10RikQ9D4J9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
4931423N10RikQ9D4J9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4931423N10RikQ9D4J9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
4931423N10RikQ9D4J9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4931423N10RikQ9D4J9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms