Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf6Q9D4J7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf6Q9D4J7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf6Q9D4J7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phf6Q9D4J7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf6Q9D4J7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf6Q9D4J7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms