Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933402E13RikQ9D4D2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.55■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4933402E13RikQ9D4D2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4933402E13RikQ9D4D2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
4933402E13RikQ9D4D2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
4933402E13RikQ9D4D2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms