Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce1Q9D495 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syce1Q9D495 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syce1Q9D495 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syce1Q9D495 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syce1Q9D495 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms