Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D930007J09RikQ9D2K6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
D930007J09RikQ9D2K6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D930007J09RikQ9D2K6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D930007J09RikQ9D2K6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms