Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spns3Q9D232 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spns3Q9D232 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spns3Q9D232 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spns3Q9D232 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spns3Q9D232 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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