Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nol3Q9D1X0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nol3Q9D1X0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nol3Q9D1X0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nol3Q9D1X0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nol3Q9D1X0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nol3Q9D1X0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms