Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl28Q9D1B9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mrpl28Q9D1B9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl28Q9D1B9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl28Q9D1B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl28Q9D1B9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms