Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem88Q9D0N8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem88Q9D0N8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem88Q9D0N8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem88Q9D0N8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem88Q9D0N8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem88Q9D0N8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem88Q9D0N8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem88Q9D0N8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms