Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Mms19Q9D071 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mms19Q9D071 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mms19Q9D071 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mms19Q9D071 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mms19Q9D071 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms19Q9D071 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms19Q9D071 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mms19Q9D071 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mms19Q9D071 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms