Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acbd6Q9D061 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Acbd6Q9D061 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Acbd6Q9D061 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Acbd6Q9D061 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Acbd6Q9D061 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acbd6Q9D061 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acbd6Q9D061 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Acbd6Q9D061 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acbd6Q9D061 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms