Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610524H06RikQ9CZU9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610524H06RikQ9CZU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
2610524H06RikQ9CZU9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms