Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MtrexQ9CZU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MtrexQ9CZU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtrexQ9CZU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MtrexQ9CZU3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms