Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3bQ9CZT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3bQ9CZT8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab3bQ9CZT8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab3bQ9CZT8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms