Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shmt2Q9CZN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shmt2Q9CZN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shmt2Q9CZN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shmt2Q9CZN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shmt2Q9CZN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms