Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem39aQ9CYC3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmem39aQ9CYC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem39aQ9CYC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem39aQ9CYC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem39aQ9CYC3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmem39aQ9CYC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmem39aQ9CYC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms