Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp8Q9CY28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtpbp8Q9CY28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp8Q9CY28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtpbp8Q9CY28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp8Q9CY28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp8Q9CY28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms