Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Alpk1Q9CXB8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alpk1Q9CXB8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk1Q9CXB8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk1Q9CXB8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alpk1Q9CXB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Alpk1Q9CXB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Alpk1Q9CXB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms