Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud1Q9CUB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud1Q9CUB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud1Q9CUB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud1Q9CUB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud1Q9CUB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud1Q9CUB6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud1Q9CUB6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud1Q9CUB6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud1Q9CUB6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms