Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gkn2Q9CQS6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gkn2Q9CQS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gkn2Q9CQS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gkn2Q9CQS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gkn2Q9CQS6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gkn2Q9CQS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gkn2Q9CQS6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gkn2Q9CQS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gkn2Q9CQS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gkn2Q9CQS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1590.5 ms