Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN3

Tomm6, Mitochondrial import receptor subunit TOM6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm6Q9CQN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm6Q9CQN3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm6Q9CQN3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tomm6Q9CQN3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tomm6Q9CQN3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tomm6Q9CQN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tomm6Q9CQN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tomm6Q9CQN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tomm6Q9CQN3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms