Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp1b2Q9CQD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b2Q9CQD4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp1b2Q9CQD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp1b2Q9CQD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms