Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC5

Cdc42ep3, Cdc42 effector protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc42ep3Q9CQC5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42ep3Q9CQC5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc42ep3Q9CQC5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdc42ep3Q9CQC5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdc42ep3Q9CQC5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdc42ep3Q9CQC5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdc42ep3Q9CQC5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdc42ep3Q9CQC5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdc42ep3Q9CQC5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdc42ep3Q9CQC5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms