Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim12aQ99PQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim12aQ99PQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim12aQ99PQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim12aQ99PQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim12aQ99PQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim12aQ99PQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim12aQ99PQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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