Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2ird2Q99NI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2ird2Q99NI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2ird2Q99NI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf2ird2Q99NI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf2ird2Q99NI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms