Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msh4Q99MT2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msh4Q99MT2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh4Q99MT2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh4Q99MT2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh4Q99MT2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh4Q99MT2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh4Q99MT2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms