Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp4Q99ME9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Gtpbp4Q99ME9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtpbp4Q99ME9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtpbp4Q99ME9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtpbp4Q99ME9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtpbp4Q99ME9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.5 ms