Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PtprtQ99M80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PtprtQ99M80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PtprtQ99M80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PtprtQ99M80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PtprtQ99M80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PtprtQ99M80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PtprtQ99M80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PtprtQ99M80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PtprtQ99M80 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PtprtQ99M80 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PtprtQ99M80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PtprtQ99M80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PtprtQ99M80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PtprtQ99M80 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
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