Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pagr1aQ99L02 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pagr1aQ99L02 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pagr1aQ99L02 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pagr1aQ99L02 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pagr1aQ99L02 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pagr1aQ99L02 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pagr1aQ99L02 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pagr1aQ99L02 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms